동강병원 외과는 현재 간담도 및 상부 위장외과, 대장 항문 외과, 내분비 및 유방외과, 혈관외과, 복강경외과 등의 전문 과목별로 진료를 하고 있다.
부설 특수 클리닉으로는 담석 클리닉, 변비 클리닉, 하지 정맥류 클리닉 등이 운영되고 있다.
간담도 외과
간, 담도 및 췌장에 발생하는 종양(대부분 악성)의 수술과, 담낭 등의 담도에 발생하는 각종 담석에 대한 수술과 담관경을 이용한 제석술 치료를 하고 있다.
상부 위장외과
주로 합병증이 발생한 위 및 십이지장의 궤양과, 위암환자의 수술을 담당하고 있다.
대장 항문외과 
항문부위에 발생하는 각종 치질, 즉 치핵, 치열, 농양, 치루와 변비 즉 배변장애, 그리고 대장 및 직장에 발생하는 암성 종양의 수술과 항암치료를 전담하고 있다.
갑상선 내분비 및 유방외과
주로 갑상선, 부신 등에 발생하는 양성 및 악성 종양의 수술을 유방외과는 유방에 발생한 양성 및 악성종양(암)의 수술과 보조 항암화학요법을 전담하고 있다.
본원은 과거엔 주로 외과적 수술에 의존하던 크기가 작은 양성 유방종양은 현재 미국 죤슨 앤 죤슨사의 맘모톰을 이용한 비수술적인 절제방식의 진단 및 치료를 시행하고 있다.혈관외과
하지 정맥류와 만성 신부전증환자의 혈액투석을 위한 동정맥루 조성술을 하고 있다.
소아외과
소아에 발생하는 서혜부 탈장과 선천성 소화기 기형 등의 수술을 전담하고 있다.
복강경외과
2003년에 내시경으로 유명한 일본 올림푸스사의 최신형 고화질 비데오 복강경시스템(EndoALPHA)을 도입한 후로는 기존에 시행하던 복강경 담당 절제 등의 담석 수술이나 급성 충수염(맹장염) 수술 외에 복강경하 위암, 대장-직장암 절제, 신장종양 적출, 부신종양 적출, 장폐색증 수술 등의 최신 복강경 수술이 기존의 많은 복부-소화기외과 수술을 대신하고 있으며 본원은 복강경 수술을 시작한 1992년 말부터 2004년, 10월 현재까지 1300례 이상의 복강경 수술을 시행한 경험을 보유하고 있다.
